O Hospital São João Batista foi reconhecido como Hospital Amigo da Criança por seu importante trabalho junto às mães quanto à amamentação, fazendo com que o hospital se tornasse referência para toda a nossa região.
        As mães são orientadas e apoiadas para o sucesso da amamentação desde o pré-natal para que as dificuldades no aleitamento materno sejam superadas, aumentando dessa forma os índices de aleitamento materno e reduzindo consideravelmente a mortalidade infantil. 
        Mantém ainda o Banco de Leite Humano onde o leite ordenhado das mães de bebês internados em Unidades Neonatais ou de doadoras (mulheres que amamentam seus bebês, mas apresentam sobra de leite produzido) são devidamente processados.
        Para a doação, as mães voluntárias são avaliadas e após aprovação, elas tornam-se doadoras, e o banco de leite retira a doação em suas residências. O leite recebido é distribuído para as crianças da UTI neonatal.